Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A11Q02978 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms