Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms