Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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