Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN10P78369 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms