Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr2fP61219 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr2fP61219 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms