Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVPABLB-1P60509 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms