Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms