Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmchP56942 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmchP56942 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmchP56942 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmchP56942 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmchP56942 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmchP56942 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmchP56942 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmchP56942 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmchP56942 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmchP56942 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms