Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSCP56915 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GSCP56915 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSCP56915 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSCP56915 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSCP56915 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSCP56915 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSCP56915 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSCP56915 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSCP56915 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSCP56915 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSCP56915 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GSCP56915 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSCP56915 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSCP56915 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSCP56915 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSCP56915 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSCP56915 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSCP56915 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSCP56915 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSCP56915 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSCP56915 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSCP56915 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSCP56915 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSCP56915 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms