Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLTPP55058 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLTPP55058 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLTPP55058 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PLTPP55058 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLTPP55058 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLTPP55058 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLTPP55058 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLTPP55058 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLTPP55058 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLTPP55058 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLTPP55058 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLTPP55058 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLTPP55058 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLTPP55058 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLTPP55058 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms