Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATXN1P54253 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms