Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms