Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.659e-9■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 GALNT2-203ENST00000488903 593 ntTSL 240.88■■■■■ 4.137e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ARIH1-206ENST00000564062 612 ntTSL 349.8■■■■■ 5.567e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ARIH1-210ENST00000570085 807 ntTSL 346.25■■■■■ 4.997e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.287e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ARIH1-209ENST00000567762 319 ntTSL 34.41□□□□□ -1.77e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DNAJB6-210ENST00000453383 590 ntTSL 419.04■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DNAJB6-206ENST00000439402 398 ntTSL 315.92■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.162e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.162e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.064e-9■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DUXAP9-202ENST00000549484 596 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.444e-9■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DUXAP9-205ENST00000619938 642 ntTSL 1 (best)17.63■□□□□ 0.414e-9■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DUXAP9-203ENST00000610585 903 ntTSL 317.23■□□□□ 0.354e-9■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DUXAP9-206ENST00000620237 770 ntTSL 516.8■□□□□ 0.284e-9■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DUXAP9-204ENST00000619210 1060 ntTSL 314.55□□□□□ -0.084e-9■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DUXAP9-207ENST00000621361 2397 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -14e-9■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 MROH1-205ENST00000527552 5832 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.736e-9■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC8.36□□□□□ -1.076e-9■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 TEX14-202ENST00000349033 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.255e-10■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.725e-10■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 TEX14-205ENST00000582740 4834 ntTSL 1 (best)9.3□□□□□ -0.925e-10■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.985e-10■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.166e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.486e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.771e-6■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SOCS7-203ENST00000617360 2051 ntTSL 525.49■■□□□ 1.671e-6■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SOCS7-204ENST00000617765 480 ntTSL 523.47■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.873e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ESYT2-204ENST00000483958 546 ntTSL 411.05□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 STARD7-202ENST00000443962 742 ntTSL 530.16■■■□□ 2.423e-6■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 STARD7-205ENST00000488084 384 ntTSL 25.45□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 INTS1-202ENST00000468115 3051 ntTSL 217.95■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 KMT5A-209ENST00000537270 352 ntTSL 527.93■■■□□ 2.064e-6■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 APLP2-212ENST00000529483 323 ntTSL 59.49□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 PEG3-203ENST00000594389 411 ntTSL 335.91■■■■□ 3.342e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.632e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 PEG3-204ENST00000594706 583 ntTSL 330.31■■■□□ 2.442e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.062e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.812e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 PEG3-209ENST00000599577 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)20.27■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 PEG3-205ENST00000596261 570 ntTSL 413.61□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 FGFR1OP-206ENST00000496181 640 ntTSL 26.48□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 DGCR8-204ENST00000457069 770 ntTSL 329.1■■■□□ 2.252e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.51e-6■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 GALNT2-205ENST00000494106 692 ntTSL 521.75■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 LINC01748-201ENST00000439156 1798 ntTSL 518.92■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 YAF2-211ENST00000547724 396 ntTSL 339.77■■■■□ 3.963e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 YAF2-213ENST00000548917 269 ntTSL 239.77■■■■□ 3.963e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 SEPT9-218ENST00000587514 540 ntTSL 534.6■■■■□ 3.133e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.953e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.933e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.83e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.793e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 SEPT9-230ENST00000590586 572 ntTSL 432.15■■■□□ 2.743e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 SEPT9-216ENST00000586812 466 ntTSL 232.15■■■□□ 2.743e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 USP6NL-204ENST00000606752 1823 ntTSL 1 (best)31.8■■■□□ 2.683e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 SEPT9-223ENST00000589140 552 ntTSL 431.37■■■□□ 2.613e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.563e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 ZNF451-216ENST00000510483 719 ntTSL 430.73■■■□□ 2.513e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 ZNF451-209ENST00000502749 790 ntTSL 530.54■■■□□ 2.483e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 RNF123-212ENST00000497099 606 ntTSL 230.23■■■□□ 2.433e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 SEPT9-243ENST00000592407 509 ntTSL 230.03■■■□□ 2.43e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MARCH8-207ENST00000602712 992 ntTSL 229.88■■■□□ 2.373e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 RSRC1-208ENST00000476899 788 ntTSL 529.55■■■□□ 2.323e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 YAF2-208ENST00000547254 571 ntTSL 529.45■■■□□ 2.313e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MON1B-210ENST00000569610 611 ntTSL 429.29■■■□□ 2.283e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MON1B-209ENST00000567291 1110 ntTSL 329.29■■■□□ 2.283e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 YAF2-210ENST00000547622 581 ntTSL 429.02■■■□□ 2.243e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MON1B-208ENST00000566963 915 ntTSL 228.56■■■□□ 2.163e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.113e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.093e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.783e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.763e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.763e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 YAF2-217ENST00000552109 1034 ntTSL 225.93■■□□□ 1.743e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 YAF2-218ENST00000552928 545 ntTSL 325.93■■□□□ 1.743e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MON1B-206ENST00000564006 948 ntTSL 225.21■■□□□ 1.633e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MON1B-204ENST00000563279 576 ntTSL 425.16■■□□□ 1.623e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.583e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.543e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 YAF2-209ENST00000547351 807 ntTSL 224.2■■□□□ 1.463e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.433e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 523.89■■□□□ 1.413e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.413e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 MON1B-205ENST00000563612 877 ntTSL 223.74■■□□□ 1.393e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 PACS2-207ENST00000548265 402 ntTSL 223.22■■□□□ 1.313e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 SEPT9-232ENST00000590825 554 ntTSL 422.16■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.083e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.083e-7■■■■■ 27.8
HNRNPMP52272 NTPCR-204ENST00000487953 527 ntTSL 321.65■■□□□ 1.063e-7■■■■■ 27.8
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 208.8 ms