Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms