Protein–RNA interactions for Protein: P40501

AVT7, Vacuolar amino acid transporter 7, yeastyeast

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT7P40501 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 YPT35YHR105W 645 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 YMR310CYMR310C 954 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 YNL320WYNL320W 855 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 YPR136CYPR136C 513 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 LCB5YLR260W 2064 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 MSS4YDR208W 2340 nt2.92□□□□□ -1.94
AVT7P40501 YDL032WYDL032W 312 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 TLG1YDR468C 675 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 SOL3YHR163W 750 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 EBP2YKL172W 1284 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 MTD1YKR080W 963 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 ERP1YAR002C-A 660 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 COS1YNL336W 1146 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 RPS7AYOR096W 573 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 SUR1YPL057C 1149 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 CMD1YBR109C 444 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 CPA2YJR109C 3357 nt2.91□□□□□ -1.94
AVT7P40501 HDA2YDR295C 2025 nt2.9□□□□□ -1.94
AVT7P40501 SIZ1YDR409W 2715 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 SYT1YPR095C 3681 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 VPS30YPL120W 1674 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YGL214WYGL214W 486 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 RPL17AYKL180W 555 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 RUF20RUF20 443 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 PFK27YOL136C 1194 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YOL166CYOL166C 339 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YOR082CYOR082C 342 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YOR114WYOR114W 885 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YPR142CYPR142C 564 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YNR063WYNR063W 1824 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 PLM2YDR501W 1566 nt2.9□□□□□ -1.95
AVT7P40501 RPL35BYDL136W 363 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 STE14YDR410C 720 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 AML1YGR001C 747 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 AGE2YIL044C 897 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 PFK26YIL107C 2484 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YLR042CYLR042C 486 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 SQS1YNL224C 2304 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 SIN4YNL236W 2925 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 POL2YNL262W 6669 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 HNT3YOR258W 654 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 REC8YPR007C 2043 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.89□□□□□ -1.95
AVT7P40501 SHQ1YIL104C 1524 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 TMA108YIL137C 2841 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 BCS1YDR375C 1371 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YLR177WYLR177W 1887 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 CSR2YPR030W 3366 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YDR340WYDR340W 303 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 ISC10YER180C 804 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 RPL30YGL030W 318 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 AAH1YNL141W 1044 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 SUT2YPR009W 807 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 ARP4YJL081C 1470 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 SUP45YBR143C 1314 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 DOA4YDR069C 2781 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 STT4YLR305C 5703 nt2.88□□□□□ -1.95
AVT7P40501 MSR1YHR091C 1932 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 TGL3YMR313C 1929 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 NUF2YOL069W 1356 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 RPN4YDL020C 1596 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 PBI1YPL272C 1554 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 SNT1YCR033W 3681 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 FLO5YHR211W 3228 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 RPS29BYDL061C 171 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 KXD1YGL079W 657 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 TAM41YGR046W 1158 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 PCL7YIL050W 858 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YJR111CYJR111C 852 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 PSY3YLR376C 729 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 GOT1YMR292W 417 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YNL035CYNL035C 1170 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 HUB1YNR032C-A 222 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YDL176WYDL176W 2127 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 AEP2YMR282C 1743 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 STP1YDR463W 1560 nt2.87□□□□□ -1.95
AVT7P40501 VTC4YJL012C 2166 nt2.86□□□□□ -1.95
AVT7P40501 DET1YDR051C 1005 nt2.86□□□□□ -1.95
AVT7P40501 USB1YLR132C 873 nt2.86□□□□□ -1.95
AVT7P40501 BUR2YLR226W 1188 nt2.86□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YAR075WYAR075W 474 nt2.86□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.86□□□□□ -1.95
AVT7P40501 RPS10BYMR230W 318 nt2.86□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YNL013CYNL013C 378 nt2.86□□□□□ -1.95
AVT7P40501 EAF7YNL136W 1278 nt2.86□□□□□ -1.95
AVT7P40501 INN1YNL152W 1230 nt2.86□□□□□ -1.95
AVT7P40501 YPR078CYPR078C 1119 nt2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.2 ms