Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms