Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCHP24723 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCHP24723 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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