Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDE6AP16499 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms