Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT13P13646 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT13P13646 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT13P13646 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT13P13646 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT13P13646 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT13P13646 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT13P13646 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT13P13646 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT13P13646 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT13P13646 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT13P13646 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT13P13646 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT13P13646 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT13P13646 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT13P13646 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT13P13646 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT13P13646 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT13P13646 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT13P13646 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT13P13646 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT13P13646 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT13P13646 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT13P13646 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT13P13646 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT13P13646 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT13P13646 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT13P13646 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT13P13646 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT13P13646 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT13P13646 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT13P13646 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT13P13646 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT13P13646 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT13P13646 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT13P13646 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT13P13646 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT13P13646 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT13P13646 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT13P13646 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT13P13646 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT13P13646 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT13P13646 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT13P13646 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT13P13646 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT13P13646 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT13P13646 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT13P13646 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT13P13646 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms