Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH1P12830 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH1P12830 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH1P12830 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDH1P12830 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDH1P12830 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDH1P12830 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDH1P12830 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDH1P12830 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDH1P12830 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDH1P12830 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH1P12830 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH1P12830 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH1P12830 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH1P12830 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH1P12830 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH1P12830 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH1P12830 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH1P12830 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDH1P12830 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH1P12830 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH1P12830 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH1P12830 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH1P12830 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH1P12830 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms