Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD28P10747 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD28P10747 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD28P10747 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD28P10747 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD28P10747 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD28P10747 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD28P10747 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD28P10747 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD28P10747 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD28P10747 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD28P10747 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD28P10747 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD28P10747 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD28P10747 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD28P10747 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms