Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGA3P0DJD8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGA3P0DJD8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms