Protein–RNA interactions for Protein: P07357

C8A, Complement component C8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8AP07357 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8AP07357 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8AP07357 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C8AP07357 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8AP07357 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C8AP07357 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C8AP07357 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8AP07357 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C8AP07357 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C8AP07357 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8AP07357 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8AP07357 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8AP07357 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8AP07357 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8AP07357 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8AP07357 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C8AP07357 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8AP07357 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8AP07357 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8AP07357 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8AP07357 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8AP07357 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8AP07357 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8AP07357 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8AP07357 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C8AP07357 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8AP07357 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8AP07357 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8AP07357 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8AP07357 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8AP07357 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8AP07357 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8AP07357 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8AP07357 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8AP07357 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8AP07357 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8AP07357 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8AP07357 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8AP07357 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8AP07357 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8AP07357 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8AP07357 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C8AP07357 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8AP07357 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C8AP07357 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8AP07357 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8AP07357 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8AP07357 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C8AP07357 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C8AP07357 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8AP07357 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8AP07357 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms