Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPLP06858 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPLP06858 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPLP06858 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPLP06858 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPLP06858 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LPLP06858 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LPLP06858 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LPLP06858 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LPLP06858 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPLP06858 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms