Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOD2P04179 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOD2P04179 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOD2P04179 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOD2P04179 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOD2P04179 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOD2P04179 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOD2P04179 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOD2P04179 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOD2P04179 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOD2P04179 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOD2P04179 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOD2P04179 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOD2P04179 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOD2P04179 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOD2P04179 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOD2P04179 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOD2P04179 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOD2P04179 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOD2P04179 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOD2P04179 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms