Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5LO95447 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5LO95447 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms