Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL5O76039 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL5O76039 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms