Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45BO75293 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45BO75293 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45BO75293 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms