Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND1O60716 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND1O60716 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms