Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMFO60524 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMFO60524 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMFO60524 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMFO60524 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMFO60524 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMFO60524 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMFO60524 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMFO60524 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMFO60524 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMFO60524 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMFO60524 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMFO60524 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMFO60524 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMFO60524 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMFO60524 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMFO60524 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMFO60524 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMFO60524 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMFO60524 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMFO60524 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMFO60524 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMFO60524 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMFO60524 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMFO60524 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMFO60524 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMFO60524 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMFO60524 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMFO60524 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMFO60524 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMFO60524 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMFO60524 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMFO60524 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMFO60524 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMFO60524 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMFO60524 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMFO60524 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMFO60524 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMFO60524 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMFO60524 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMFO60524 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMFO60524 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMFO60524 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMFO60524 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMFO60524 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMFO60524 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMFO60524 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMFO60524 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMFO60524 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMFO60524 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMFO60524 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMFO60524 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms