Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYNGR1O43759 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms