Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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MTSS1O43312 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MTSS1O43312 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTSS1O43312 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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