Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEFVO15553 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEFVO15553 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEFVO15553 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEFVO15553 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEFVO15553 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEFVO15553 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEFVO15553 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEFVO15553 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEFVO15553 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEFVO15553 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEFVO15553 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEFVO15553 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEFVO15553 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEFVO15553 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEFVO15553 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEFVO15553 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEFVO15553 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEFVO15553 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEFVO15553 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEFVO15553 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEFVO15553 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEFVO15553 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEFVO15553 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEFVO15553 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MEFVO15553 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEFVO15553 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MEFVO15553 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEFVO15553 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEFVO15553 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms