Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2LO15068 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCF2LO15068 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms