Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE2AO00408 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE2AO00408 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms