Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1330D3Z460 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms