Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms