Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC162PA2VCL2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC162PA2VCL2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms