Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms