Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPDC1A2A3K4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms