Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn8Q9Z260 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms