Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms