Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9Y3F1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms