Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNRF3Q9ULT6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNRF3Q9ULT6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms