Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C4Q9UKN8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms