Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms