Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJB4Q9UDY4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB4Q9UDY4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms