Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX2Q9UBZ4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms