Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBP1Q9NZI7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBP1Q9NZI7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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