Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC4Q9HBW1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms